246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0076 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0076  flagellar motor switch protein G  100 
 
 		 337 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0082  flagellar motor switch protein G  87.24 
 
 		 337 aa  594  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3978  flagellar motor switch protein G  83.49 
 
 		 328 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3475  flagellar motor switch protein G  83.18 
 
 		 328 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3658  flagellar motor switch protein G  80.3 
 
 		 338 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04974  flagellar motor switch protein G  44.62 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4416  flagellar motor switch protein FliG  45.37 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.202988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0251  flagellar motor switch protein G  44.64 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0233  flagellar motor switch protein G  44.41 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0632  flagellar motor switch protein G  44.41 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0712  flagellar motor switch protein G  44.41 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3381  flagellar motor switch protein G  44.35 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001187  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3564  flagellar motor switch protein G  35.67 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0172  flagellar motor switch protein G  37.54 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0224  flagellar motor switch protein G  37.54 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4656  flagellar motor switch protein G  37.58 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.508113  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  31.99 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  32.71 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  33.33 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  32.4 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  32.05 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  32.4 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  30.84 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  31.78 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  31 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  30.84 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  30.94 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  31.55 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  30.84 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  30.84 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  30.94 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  31.91 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  31.65 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  30.84 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  32.92 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  31.46 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  31.78 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  30.38 
 
 		 351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  31.33 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  29.57 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  30.06 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  31.17 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  32.42 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  31.27 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  30.06 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  29.75 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  29.48 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  30.16 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  30.5 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  28.96 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  30.58 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  30.89 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  31.15 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  30.31 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  30.72 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  29.25 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  30.19 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  29.25 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  31.65 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  31.65 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  28.53 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  28.71 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  30.38 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  28.93 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  28.48 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  29.91 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  29.27 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  29.06 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  26.1 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  26.65 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  27.58 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  26.33 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  27.94 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  28.12 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  27.94 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  28.08 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  28.89 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  25.31 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  27.07 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  27.88 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  26.71 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  28.39 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  28.21 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  28.09 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>