271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0068 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  87.05 
 
 
139 aa  253  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  83.45 
 
 
138 aa  239  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  81.29 
 
 
138 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  81.02 
 
 
139 aa  231  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.42 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  57.82 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  52.48 
 
 
144 aa  157  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  56.64 
 
 
144 aa  156  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  54.23 
 
 
141 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  54.23 
 
 
141 aa  153  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.74 
 
 
132 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  53.52 
 
 
141 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.01 
 
 
138 aa  151  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  53.1 
 
 
146 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.55 
 
 
138 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  53.1 
 
 
146 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  55 
 
 
142 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 
147 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
147 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  52.11 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  52.11 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  49.32 
 
 
147 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
146 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  49.66 
 
 
146 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3577  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.92 
 
 
142 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 
136 aa  133  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.45 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  47.45 
 
 
138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  44.53 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 
138 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  46.38 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.58 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 
138 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.19 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.97 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  47.1 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.3 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 
139 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.8 
 
 
133 aa  116  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.53 
 
 
136 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  39.86 
 
 
137 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.26 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  39.42 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  38.69 
 
 
138 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 
134 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 
134 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.53 
 
 
134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.53 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
135 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
140 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
135 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0519  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.77 
 
 
189 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.72 
 
 
134 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.26 
 
 
134 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.94 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  41.01 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  44.7 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  42.34 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 
135 aa  106  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
134 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
134 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
134 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
134 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
134 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.67 
 
 
135 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.84 
 
 
140 aa  103  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1671  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
138 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662935  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.69 
 
 
140 aa  102  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 
134 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.69 
 
 
140 aa  102  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>