227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0056 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  68.86 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  57.55 
 
 		 448 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  56.24 
 
 		 448 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  52.95 
 
 		 448 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  32.54 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  31.14 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.45 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.64 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.78 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  30.18 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.49 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.42 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.3 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.06 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  27.7 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  32.55 
 
 		 781 aa  146  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  28.15 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.91 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  26.16 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.16 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.16 
 
 		 502 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.16 
 
 		 500 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  26.2 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.44 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.61 
 
 		 502 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.85 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.79 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.6 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  26.52 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.15 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.03 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  29.6 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.53 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.53 
 
 		 456 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  27.35 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  28.45 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  27.64 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25.48 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.81 
 
 		 507 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.81 
 
 		 507 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  25.5 
 
 		 513 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.44 
 
 		 473 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  25.81 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  25.81 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  25.81 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  25.81 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  25.6 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  28.63 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  29.45 
 
 		 474 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.19 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  26.86 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.65 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.63 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  28.47 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 475 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  29.1 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27.52 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.31 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  25.58 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.85 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.85 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.98 
 
 		 657 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.58 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  27.27 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  26.97 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.3 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  25.4 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  27.75 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  27.75 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  27.75 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  28.11 
 
 		 677 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  27.68 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.5 
 
 		 468 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.65 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.57 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  25.83 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  26.64 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  26.45 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  25.83 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  28.07 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.31 
 
 		 475 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 		 506 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  24.08 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  24.08 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 		 506 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 		 506 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 		 506 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  25 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>