254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0050 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0050  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  83.86 
 
 		 285 aa  500  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3632  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.81 
 
 		 285 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.189643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3448  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.7 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.894431  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04950  flagellar motor protein MotA  50.7 
 
 		 285 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0283  flagellar motor protein MotA  49.83 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0606654  normal  0.545308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3351  flagellar motor protein MotA  49.83 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001166  Flagellar motor rotation protein MotA  51.5 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0192  flagellar motor protein MotA  48.93 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0201  flagellar motor protein MotA  45.74 
 
 		 283 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0153  flagellar motor protein MotA  45.39 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0661  flagellar motor protein MotA  48.93 
 
 		 288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0201  flagellar motor protein MotA  49.64 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.11554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4665  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.01 
 
 		 290 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.43 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  41.37 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  41.37 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  40.88 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0730  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.56 
 
 		 201 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  39.7 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  37.37 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 286 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  37.01 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  37.01 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  37.28 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  36.92 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  36.17 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  37.28 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  36.52 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.77 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  36.92 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  36.92 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  36.52 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  36.92 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  37.19 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  36.56 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  37.37 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.895123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  38.21 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  36.88 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  36.2 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  36.52 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  35.84 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  36.49 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  36.5 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  36.5 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  36.5 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  36.5 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  36.5 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  36.84 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  36.04 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  36.04 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  36.04 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  35.46 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  37.1 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  36.07 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  34.74 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.38 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  34.04 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  33.21 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  34.63 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  35.11 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  35.11 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  34.98 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  33.69 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  33.33 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  36.23 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1711  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.172807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  37.23 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.43 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  33.81 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  32.13 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2583  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.11 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.756929  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.98 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  35.09 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  33.82 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  32.27 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  34.66 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.49 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>