93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0082 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0082  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0059  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 78 bp  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  96 
 
 		 78 bp  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0016  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0046  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0049  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0046  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923307  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0051  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0045  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0020  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14012  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2553699999999997e-37  hitchhiker  0.00000344638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06170  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.58434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37120  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176209  normal  0.041751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0724016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0005  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0035  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0062  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000079557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0060  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.695834  hitchhiker  0.0000996244 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0439  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000182942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0022  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>