241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0065 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  98.46 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0048  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0040  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10740  tRNA-Glu  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0961043  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0024  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0025  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0014  tRNA-Glu  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0013  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08680  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0064  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.373773  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0052  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0012  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>