48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0049 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.890961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  90.48 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  95.24 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  95.24 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0049  tRNA-Val  86.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0038  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0044  tRNA-Val  87.88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0054  tRNA-Val  87.88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0031  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  90.91 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  85.53 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.598097  normal  0.464383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4328  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0024  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.540332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0014  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.167112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0042  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>