39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9304 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  223  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  52.94 
 
 
134 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  46.59 
 
 
185 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  46.74 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  42.55 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  41.3 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  37.65 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  35.44 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  38.46 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  35.9 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  37.18 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  30.99 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  35.9 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  34.09 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  34.09 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  30.77 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  30.49 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  25.53 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  21.43 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  21.69 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  30.49 
 
 
133 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  20.24 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  33.78 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  35.38 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  21.25 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  26.03 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  38.98 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  28.92 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  27.16 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  20.25 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  56.25 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  21.25 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  26.44 
 
 
131 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>