38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9280 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2381  hypothetical protein  47.41 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  43.85 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2620  hypothetical protein  41.67 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0797  hypothetical protein  38.81 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2947  hypothetical protein  36.72 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  25.76 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4494  hypothetical protein  31.2 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  39.6 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  32.04 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  25.32 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  27.15 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  28.91 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  29.36 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  25.58 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  25.47 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  30.19 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  25.47 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  32.22 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  23.7 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  28.16 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  23.7 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  24.44 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  24.44 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  25.23 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>