More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9262 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
457 aa  913    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.74 
 
 
447 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
475 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  45.95 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  43.74 
 
 
450 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  43.02 
 
 
453 aa  289  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  40.09 
 
 
469 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  41.03 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  42.86 
 
 
490 aa  267  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  38.82 
 
 
455 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  42.23 
 
 
480 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  50.71 
 
 
456 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.19 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
490 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
352 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  42.32 
 
 
523 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  45.56 
 
 
465 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  35.65 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
420 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  35 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.48 
 
 
477 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
586 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
524 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
484 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.13 
 
 
486 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
455 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
470 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.17 
 
 
466 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  32.6 
 
 
452 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
515 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  31.9 
 
 
449 aa  156  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
469 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
459 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
469 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
504 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0754  histidine kinase  37.32 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.15 
 
 
466 aa  152  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  38.2 
 
 
471 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  37.92 
 
 
481 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
509 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  39.38 
 
 
583 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
478 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
492 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  38.71 
 
 
475 aa  150  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  32.32 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
452 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.88 
 
 
477 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
447 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  35.76 
 
 
490 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
406 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.55 
 
 
461 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
534 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  37.57 
 
 
508 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  43.15 
 
 
442 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
544 aa  143  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
377 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
475 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  41.12 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
504 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  40.88 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.12 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  34.58 
 
 
507 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  30.43 
 
 
497 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
607 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  35.44 
 
 
555 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  36.12 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
469 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
607 aa  139  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
479 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
529 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
490 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
464 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  33.88 
 
 
413 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
545 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  31.48 
 
 
448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  35.63 
 
 
586 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  35.38 
 
 
491 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  34.93 
 
 
520 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
469 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  39.86 
 
 
517 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  37.11 
 
 
398 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
469 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  35.25 
 
 
592 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
487 aa  136  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  35.33 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  27.78 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>