More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9142 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  65.05 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  61.39 
 
 		 108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  140  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  60.78 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  56.86 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  59.41 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  57.84 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  54.81 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  51.96 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  50.51 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  53.47 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  121  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  121  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  57.89 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  52.63 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  52.88 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  53 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  55.79 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  51.55 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  51.49 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.92 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  55 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.61 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  55.1 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  51.58 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  50.5 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  51 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  53.06 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  53.06 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  43.4 
 
 		 223 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  52.13 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.04 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  54.08 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  47.52 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  54.17 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50.52 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  51.02 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  47.52 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  53.06 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  51.52 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  50.49 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48.51 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  50.98 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  53.12 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  48.39 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  48.45 
 
 		 109 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>