27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9064 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  858    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  73.5 
 
 
475 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  35.31 
 
 
488 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  33.23 
 
 
507 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  27.35 
 
 
526 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  26.12 
 
 
502 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.26 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  25.93 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  28.97 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  24.56 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  24.65 
 
 
449 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  32.69 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  56.76 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  60 
 
 
418 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  26.86 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  55 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  70 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  27.82 
 
 
315 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 
441 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  24.6 
 
 
524 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  21.66 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  24.91 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  70 
 
 
161 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  58.82 
 
 
443 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  24.25 
 
 
443 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  21.75 
 
 
460 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  32.37 
 
 
475 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>