More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9059 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  69.21 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  61.15 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  44.47 
 
 		 452 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 		 438 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  41.58 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 465 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  36.46 
 
 		 396 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  26.71 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  26.74 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  26.37 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  26.37 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  26.37 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  29.17 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.12 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.12 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.88 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.88 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  29.46 
 
 		 709 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.63 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 436 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  28.82 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  31.75 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.53 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  24.63 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  31.76 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.53 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.13 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.13 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  21.75 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.51 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.18 
 
 		 688 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  23.53 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.58 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.86 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  32.43 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  21.78 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  21.78 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  24.44 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  31.98 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  31.98 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  31.98 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  31.98 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  31.98 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  23.72 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 730 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  31.08 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.66 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.57 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>