262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9043 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  313  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 162 aa  247  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  74.83 
 
 		 167 aa  223  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  36.43 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.55 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.89 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  32.8 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  31.46 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.85 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  31.46 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  32.82 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30.68 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.58 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.87 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  35.58 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  37.68 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  27.69 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.34 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>