132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9038 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  487  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  79.76 
 
 
249 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  79.92 
 
 
264 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  75 
 
 
253 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  72.76 
 
 
247 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  39.27 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  42.74 
 
 
250 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  42.74 
 
 
250 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  38.46 
 
 
254 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  41.3 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  41.3 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.06 
 
 
248 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  36.89 
 
 
267 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  40.08 
 
 
250 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  37.4 
 
 
251 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
254 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  40.49 
 
 
251 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  39.52 
 
 
251 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  45.93 
 
 
263 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  39.52 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
251 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  39.34 
 
 
251 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  39.27 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.37 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  36.03 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  44.08 
 
 
248 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  36.48 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  37.8 
 
 
273 aa  161  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  40.41 
 
 
250 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.42 
 
 
244 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  39.52 
 
 
250 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  39.36 
 
 
250 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  40.64 
 
 
251 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  41.15 
 
 
244 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  42.68 
 
 
246 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
402 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  38.93 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  37.96 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  42.04 
 
 
254 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  44.08 
 
 
244 aa  154  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  42.04 
 
 
252 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  42.04 
 
 
252 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  36.33 
 
 
250 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  38.78 
 
 
247 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  42.26 
 
 
243 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  40.49 
 
 
252 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  38.06 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  40.56 
 
 
250 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 
251 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
258 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.16 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.2 
 
 
249 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  44.76 
 
 
261 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  35.66 
 
 
252 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  41.67 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  33.2 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  34.96 
 
 
255 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.69 
 
 
249 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.49 
 
 
251 aa  122  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.65 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  43.61 
 
 
137 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.72 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.04 
 
 
250 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.9 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  37.1 
 
 
255 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  33.33 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.24 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  35.09 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  35.71 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  39.73 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  34.51 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  32.82 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  32.3 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  32.46 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
309 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.91 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  29.2 
 
 
311 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  31.36 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.92 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.71 
 
 
327 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  28.14 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  29.78 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.28 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.85 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>