245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9016 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  40.29 
 
 
281 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  40.29 
 
 
290 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 
293 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
298 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.71 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
293 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.13 
 
 
301 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.79 
 
 
288 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.45 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.63 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.64 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
291 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 
289 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  34.15 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 
288 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.49 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.04 
 
 
299 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
294 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
289 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
296 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
296 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.97 
 
 
294 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  32.86 
 
 
292 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.15 
 
 
283 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.9 
 
 
291 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
293 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.72 
 
 
298 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  31.5 
 
 
277 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.72 
 
 
298 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
297 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.72 
 
 
298 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
287 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.95 
 
 
289 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.28 
 
 
287 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 
277 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  30.67 
 
 
304 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  31.07 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32 
 
 
290 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30.55 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  37.34 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  30.69 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.92 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.33 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  29.63 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  32.53 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  30.79 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.01 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  39.86 
 
 
147 aa  90.9  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  29.52 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  32.06 
 
 
393 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  31.47 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  28.81 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  29.59 
 
 
303 aa  89  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 
306 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.07 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  31.94 
 
 
288 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  30.74 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  41.13 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  28.07 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  28.07 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  28.07 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 
296 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.18 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  33.12 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.76 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  32.02 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  25.52 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  31.5 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.82 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.33 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  26.6 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  28.27 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  28.27 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  30.99 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  30.04 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>