More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8998 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  75.38 
 
 		 209 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  47.19 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  31.98 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  33.75 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.37 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.89 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  39.53 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>