137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8908 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  74.7 
 
 		 659 aa  933    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 672 aa  1331    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  49.44 
 
 		 719 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  52.08 
 
 		 680 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  51.82 
 
 		 695 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  51.48 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  52.03 
 
 		 684 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  52.58 
 
 		 679 aa  575  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.44 
 
 		 695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.85 
 
 		 645 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  50.29 
 
 		 717 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  51.12 
 
 		 666 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  48.18 
 
 		 727 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.81 
 
 		 670 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  46.35 
 
 		 792 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.29 
 
 		 710 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.03 
 
 		 861 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.12 
 
 		 741 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  33.88 
 
 		 1048 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  32.82 
 
 		 706 aa  257  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.2 
 
 		 757 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.78 
 
 		 693 aa  254  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  30.9 
 
 		 759 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.98 
 
 		 732 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  31.63 
 
 		 735 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  31.82 
 
 		 758 aa  241  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.61 
 
 		 705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.03 
 
 		 804 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  32.4 
 
 		 726 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  33.15 
 
 		 706 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  32.82 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  29.52 
 
 		 742 aa  223  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.39 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.22 
 
 		 766 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  31.74 
 
 		 703 aa  210  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.38 
 
 		 724 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.67 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.67 
 
 		 764 aa  203  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.89 
 
 		 742 aa  200  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.01 
 
 		 742 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.23 
 
 		 813 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  34.13 
 
 		 759 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  28.44 
 
 		 716 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.21 
 
 		 747 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.4 
 
 		 746 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.9 
 
 		 733 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25.8 
 
 		 691 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  35.99 
 
 		 771 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  34.07 
 
 		 874 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  36.93 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  37.75 
 
 		 750 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  40.88 
 
 		 799 aa  185  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.67 
 
 		 702 aa  183  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  38.5 
 
 		 754 aa  183  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  39.2 
 
 		 776 aa  183  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  37.53 
 
 		 726 aa  183  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  34.81 
 
 		 734 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  25.6 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  25.6 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  25.6 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  25.31 
 
 		 689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.02 
 
 		 689 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.02 
 
 		 689 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.69 
 
 		 732 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  29.19 
 
 		 717 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  25.17 
 
 		 691 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.62 
 
 		 755 aa  178  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  25.24 
 
 		 760 aa  176  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.66 
 
 		 788 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.51 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.71 
 
 		 715 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.53 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  25.18 
 
 		 689 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.07 
 
 		 795 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.11 
 
 		 691 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.36 
 
 		 758 aa  171  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.35 
 
 		 748 aa  170  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  27.18 
 
 		 715 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  25.35 
 
 		 702 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  34.09 
 
 		 829 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.96 
 
 		 786 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  33.1 
 
 		 724 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  33.1 
 
 		 724 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  33.12 
 
 		 761 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.81 
 
 		 832 aa  158  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  32.86 
 
 		 724 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  41.28 
 
 		 902 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  24.8 
 
 		 748 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  37.38 
 
 		 780 aa  138  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  36.84 
 
 		 706 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.04 
 
 		 768 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  36.84 
 
 		 706 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  24.18 
 
 		 764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  31.97 
 
 		 710 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.09 
 
 		 716 aa  133  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  25.74 
 
 		 762 aa  133  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  30.85 
 
 		 755 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.88 
 
 		 776 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.88 
 
 		 777 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  34.29 
 
 		 778 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>