214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8880 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  776    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  74.87 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  60.56 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  54.52 
 
 		 625 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  56.5 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  54.83 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  54.35 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  53.32 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  54.81 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  50.26 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  49.51 
 
 		 442 aa  345  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  46.35 
 
 		 410 aa  345  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  50.93 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  46.09 
 
 		 410 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  45.57 
 
 		 409 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  48.47 
 
 		 412 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  50.52 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.14 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  51.84 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  46.49 
 
 		 403 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  51.06 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  41.79 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  41.54 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  43.01 
 
 		 400 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  44.33 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  44.01 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  45.62 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  41.75 
 
 		 407 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 407 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.13 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  41.49 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  42.89 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  41.49 
 
 		 397 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  44.26 
 
 		 416 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  44.54 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  40.44 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  40.77 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  45.88 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  43.99 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  45.19 
 
 		 396 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  44.94 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  44.94 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  37.93 
 
 		 400 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  40.33 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  43.13 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  43.13 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  39.25 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  42.67 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  42.86 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  42.63 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  38.98 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  42.63 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  42.4 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  42.13 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  42.4 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  42.13 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  42.13 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  41.87 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  41.87 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  37.47 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  32.56 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  42.42 
 
 		 245 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.53 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  31.02 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 368 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.75 
 
 		 373 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.75 
 
 		 373 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.75 
 
 		 373 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.75 
 
 		 373 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.75 
 
 		 373 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  32.75 
 
 		 368 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>