More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8877 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  100 
 
 		 598 aa  1130    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  61.71 
 
 		 225 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0218  hypothetical protein  41.57 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.52 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  32.79 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  42.57 
 
 		 393 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  34.84 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 622 aa  99.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  38.35 
 
 		 353 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 521 aa  90.1  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  34.62 
 
 		 400 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  34.13 
 
 		 408 aa  87  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  34.13 
 
 		 408 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.73 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  34.67 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  29.91 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  29.46 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.41 
 
 		 438 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  30.9 
 
 		 324 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  33 
 
 		 405 aa  73.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 509 aa  72  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 448 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  29.69 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  30.88 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  30.35 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.65 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 663 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.96 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  29.96 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  28.85 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 410 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 390 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 390 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 322 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  30.05 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 416 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  28.23 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  27.5 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  29.52 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4231  hypothetical protein  31.9 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  30.24 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  30.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  30.99 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.27 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  28.06 
 
 		 372 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 397 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  28.96 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  31.86 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  31.37 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  28.96 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  25.45 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>