More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8876 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  100 
 
 
393 aa  736    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.39 
 
 
380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  38.38 
 
 
386 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  38.1 
 
 
225 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  37.71 
 
 
598 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  26.3 
 
 
353 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  24.58 
 
 
353 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  24.86 
 
 
353 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  24.3 
 
 
353 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 
536 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 
622 aa  97.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.68 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 
457 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  26.01 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.15 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.96 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
400 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  24.86 
 
 
357 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  26.72 
 
 
384 aa  93.2  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 
500 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  29.54 
 
 
323 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.93 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.93 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 
353 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.67 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 
414 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 
448 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  25.55 
 
 
357 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  24.86 
 
 
348 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 
322 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 
521 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  27.13 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  23.97 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  24.67 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  24.93 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  24.67 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.32 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  24.18 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  22.99 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  24.2 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
322 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  24.4 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  24.44 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 
448 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 
641 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0218  hypothetical protein  31.76 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.13 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  25.77 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  24.42 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  26.22 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 
621 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  23.35 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.13 
 
 
663 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  24.86 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.67 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  24.23 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  23.05 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  24.63 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.8 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.44 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  30.41 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.48 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  25.25 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  21.33 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.74 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  24.11 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 
455 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>