More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8874 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
418 aa  811    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  74.4 
 
 
417 aa  554  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  61.48 
 
 
409 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  58.77 
 
 
401 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  51.07 
 
 
410 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.38 
 
 
405 aa  299  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  42.18 
 
 
406 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  41.47 
 
 
400 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  41.2 
 
 
410 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  41.45 
 
 
402 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  38.63 
 
 
406 aa  272  9e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  41.53 
 
 
443 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  41.65 
 
 
412 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  40.76 
 
 
400 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  40.52 
 
 
405 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  40.95 
 
 
400 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  41.19 
 
 
400 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  42.52 
 
 
409 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  40.66 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  42.55 
 
 
409 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 
406 aa  262  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  38.59 
 
 
406 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  38.68 
 
 
401 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  39.67 
 
 
401 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.38 
 
 
410 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  43.36 
 
 
405 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  42.18 
 
 
409 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  41.78 
 
 
408 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  37.59 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  40.43 
 
 
411 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  41.55 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  38.93 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  41.47 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  40.85 
 
 
408 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  38.41 
 
 
391 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  43.79 
 
 
409 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  43.33 
 
 
409 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.53 
 
 
405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  43.33 
 
 
409 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.57 
 
 
403 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  39.9 
 
 
400 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  38.89 
 
 
402 aa  247  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  38.35 
 
 
653 aa  245  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  40.76 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  38.88 
 
 
401 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  39.28 
 
 
658 aa  243  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  39.17 
 
 
423 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 
401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  37.65 
 
 
401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  37.65 
 
 
405 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  41.9 
 
 
409 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  39.23 
 
 
402 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  39.23 
 
 
402 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  36.84 
 
 
392 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  39.05 
 
 
403 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38.03 
 
 
657 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.44 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  37.83 
 
 
405 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  39.63 
 
 
415 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  38.41 
 
 
407 aa  233  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.83 
 
 
405 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  35.84 
 
 
657 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  35.68 
 
 
404 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  38.69 
 
 
405 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.45 
 
 
403 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  35.45 
 
 
404 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  38.72 
 
 
394 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  38.32 
 
 
411 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  38.3 
 
 
403 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  34.05 
 
 
394 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.94 
 
 
409 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  38.77 
 
 
409 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.2 
 
 
663 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  36.52 
 
 
657 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.2 
 
 
663 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  36.08 
 
 
657 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  34.82 
 
 
454 aa  226  7e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  38.5 
 
 
409 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  38.48 
 
 
644 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  34.87 
 
 
656 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.47 
 
 
670 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  33.62 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  39.25 
 
 
431 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  33.95 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  37.71 
 
 
402 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  35.46 
 
 
409 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  36.26 
 
 
405 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  35.9 
 
 
420 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  37.09 
 
 
405 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  36.74 
 
 
420 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 
420 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  37.09 
 
 
405 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 
654 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  38.16 
 
 
414 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  36.62 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  33.97 
 
 
394 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  35.85 
 
 
648 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  35.85 
 
 
648 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.43 
 
 
647 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  38.15 
 
 
671 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>