213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8866 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
279 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  36.77 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  32.37 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  44.86 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.49 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  31.74 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.12 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  39.13 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  37.56 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  39.42 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  48.61 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 
399 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  25.63 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  35.45 
 
 
361 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  28.83 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  39 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  48.65 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  31.4 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  45.95 
 
 
346 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  37.27 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  44.3 
 
 
361 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
449 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  36.28 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  49.21 
 
 
369 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  28.28 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  43.53 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
290 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.81 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  44 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  40.19 
 
 
142 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  23.44 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  24.28 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  23.44 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  24.86 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  24.86 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>