More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8772 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  57.75 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  52.82 
 
 		 197 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  54.26 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  55.08 
 
 		 191 aa  194  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 		 193 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  35.56 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  31.38 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  36.97 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  25.14 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  22.03 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  28.89 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  29.21 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.74 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.74 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.13 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  25.39 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  27.1 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.86 
 
 		 600 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  22.81 
 
 		 567 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  31.36 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  28.85 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  25.54 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  25.91 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  27.8 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.62 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.28 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.22 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.92 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  25.69 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.92 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  29 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  32.21 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  27.89 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.63 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  26.23 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  24.14 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  25.77 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 332 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  27.61 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  26.63 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  26.59 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  23.68 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  28.18 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  24.03 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 862 aa  55.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.95 
 
 		 846 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 		 485 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  26.37 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  27.96 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  25.76 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  28.37 
 
 		 929 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  24.46 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.83 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.26 
 
 		 1033 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.77 
 
 		 401 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>