More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8714 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  100 
 
 
936 aa  1815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  46.05 
 
 
929 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  43.64 
 
 
930 aa  592  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  44.3 
 
 
928 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  45.46 
 
 
903 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 
905 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  45.88 
 
 
940 aa  555  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 
918 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
937 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  43.6 
 
 
937 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 
937 aa  519  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  42.21 
 
 
919 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 
925 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
950 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.77 
 
 
894 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  39.57 
 
 
923 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.25 
 
 
919 aa  357  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
911 aa  347  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  39.07 
 
 
884 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  36.68 
 
 
913 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.85 
 
 
938 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 
904 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 
923 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 
909 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 
928 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 
927 aa  258  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.24 
 
 
917 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  44.71 
 
 
946 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
889 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 
927 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 
910 aa  221  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  39.12 
 
 
928 aa  217  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  38.43 
 
 
922 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.89 
 
 
879 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  41.76 
 
 
920 aa  202  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  42.7 
 
 
884 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  39.58 
 
 
955 aa  195  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.43 
 
 
923 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  50.45 
 
 
240 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  39.86 
 
 
892 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
953 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  37.09 
 
 
934 aa  177  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 
929 aa  175  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.88 
 
 
940 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 
995 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.14 
 
 
923 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.51 
 
 
961 aa  164  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 
916 aa  142  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 
1064 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 
927 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
915 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 
916 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 
959 aa  99.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
919 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.42 
 
 
919 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.42 
 
 
919 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
1015 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 
940 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 
998 aa  85.1  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 
894 aa  81.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 
997 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  38.02 
 
 
893 aa  79.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  29.97 
 
 
929 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 
913 aa  78.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
881 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
881 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 
947 aa  77.4  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
876 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 
981 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
910 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.13 
 
 
913 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  41.73 
 
 
956 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
1000 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 
921 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
921 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 
921 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
189 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
877 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  36.26 
 
 
921 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 
946 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 
953 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 
960 aa  68.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  35.83 
 
 
977 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
236 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 
1104 aa  65.1  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  32.47 
 
 
855 aa  64.7  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
948 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 
967 aa  63.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.31 
 
 
1075 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 
998 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 
974 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  27.57 
 
 
907 aa  62.4  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 
951 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 
876 aa  62.4  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
932 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 
992 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 
835 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 
897 aa  61.6  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 
983 aa  61.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
1030 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>