More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8675 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
157 aa  310  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1226  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  34.58 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  53.73 
 
 
261 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
259 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
234 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  55.74 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  49.33 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  42.16 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  44.62 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
256 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
243 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
253 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  39.05 
 
 
253 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  47.3 
 
 
253 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
248 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
254 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40.18 
 
 
249 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  52.46 
 
 
263 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.61 
 
 
240 aa  61.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  35.11 
 
 
255 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  35.11 
 
 
255 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  35.11 
 
 
255 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 
249 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 
261 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  43.66 
 
 
243 aa  60.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.66 
 
 
243 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
239 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
239 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
255 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  50.77 
 
 
270 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 
253 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 
255 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 
239 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
250 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4439  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.25 
 
 
245 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 
253 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0266  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.86 
 
 
245 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  35.83 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  36.67 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  35.83 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  35.83 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
222 aa  58.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  46.03 
 
 
239 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  35.83 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
252 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  35.83 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  37.86 
 
 
250 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  41.28 
 
 
231 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
239 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  52.38 
 
 
261 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  52.38 
 
 
261 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  37.63 
 
 
245 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  48 
 
 
288 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  43.66 
 
 
231 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  43.66 
 
 
231 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  43.66 
 
 
231 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
249 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  42.25 
 
 
244 aa  57.4  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
238 aa  57.4  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
249 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  42.42 
 
 
342 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  43.66 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 
240 aa  57  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  49.18 
 
 
252 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  43.75 
 
 
252 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 
248 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 
288 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
237 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  32.35 
 
 
231 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 
554 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  42.19 
 
 
247 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
247 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  41.1 
 
 
237 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
247 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 
259 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
256 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>