70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8660 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  928    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  56.95 
 
 
454 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  56.7 
 
 
456 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  56.36 
 
 
456 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  51.53 
 
 
464 aa  448  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  46.99 
 
 
433 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  43.97 
 
 
459 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  42 
 
 
467 aa  305  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  56.36 
 
 
283 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  38.81 
 
 
477 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  38.55 
 
 
470 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  41.36 
 
 
492 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  50.69 
 
 
226 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  59.65 
 
 
114 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  54.65 
 
 
89 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  48.28 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  44.94 
 
 
106 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.78 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  52.46 
 
 
66 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.88 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.15 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.74 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.87 
 
 
477 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.62 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  25.77 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.86 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.65 
 
 
387 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.48 
 
 
442 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.53 
 
 
363 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.48 
 
 
393 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.99 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  25.38 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  24.22 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.88 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  25.19 
 
 
323 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.75 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  26.63 
 
 
471 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.76 
 
 
378 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.28 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.03 
 
 
374 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.85 
 
 
378 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  26.63 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.92 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.64 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.1 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.32 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.28 
 
 
487 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25 
 
 
391 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  23.67 
 
 
411 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  24.18 
 
 
452 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.27 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.76 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.06 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.9 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.12 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.82 
 
 
357 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  34.03 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.51 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  24.73 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  24.73 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  29.17 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  20.54 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.09 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  26.32 
 
 
451 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  27.36 
 
 
384 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  25.14 
 
 
198 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.9 
 
 
383 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  25 
 
 
388 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>