89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8567 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  74.84 
 
 
329 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  58.1 
 
 
343 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  54.51 
 
 
361 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  50.49 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  53.47 
 
 
361 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  55.1 
 
 
376 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  50.47 
 
 
347 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  51.19 
 
 
351 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  54.96 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  46.18 
 
 
305 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  46.25 
 
 
298 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  38.7 
 
 
368 aa  162  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  42.75 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  42.68 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  40.42 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  42.21 
 
 
320 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.62 
 
 
318 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  42.62 
 
 
318 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  42.21 
 
 
318 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  39.53 
 
 
314 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  48.26 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  46.27 
 
 
270 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  41.54 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  25.98 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.48 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.48 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  31.48 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.48 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  23.86 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.48 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.48 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  36.41 
 
 
207 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.21 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  30.99 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  23.08 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.96 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  30.46 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  30.28 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  22.56 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  22.56 
 
 
211 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  22.56 
 
 
211 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.28 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  22.56 
 
 
197 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
210 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  22.56 
 
 
197 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  30.58 
 
 
244 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  30.25 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  22.05 
 
 
197 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  30.22 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  33.33 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  33.5 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  26.9 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  20.51 
 
 
197 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  29.09 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.08 
 
 
255 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  28.5 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  30.91 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  30 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  27.64 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  33.01 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  27.1 
 
 
255 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
216 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  28.87 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  29.11 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  25.47 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  28.86 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  30.85 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  27.5 
 
 
261 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  28 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  32.46 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  25 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3224  lipolytic protein G-D-S-L family  26.36 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  27.72 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  28.06 
 
 
240 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  27 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  27.09 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  28.19 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  30.6 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  33.33 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  27.14 
 
 
216 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  31.82 
 
 
210 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  28.34 
 
 
264 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  27.14 
 
 
216 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  23.14 
 
 
264 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>