210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8490 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 396 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  51.8 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  52.17 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.36 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.11 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  29.53 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  28.23 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 465 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  28.78 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.02 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 415 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  31.97 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 435 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.89 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  26.13 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.22 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  26.61 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 421 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.81 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  27.62 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  29.49 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  27.13 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.13 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  27.98 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.13 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.39 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  31.76 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  31.76 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  31.76 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  31.76 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  31.76 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>