More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8460 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  100 
 
 		 394 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  55.84 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.52 
 
 		 422 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.99 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.04 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  48.04 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  51.46 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.41 
 
 		 392 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.21 
 
 		 395 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.83 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.65 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  44.3 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  44.3 
 
 		 391 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.15 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.89 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  41.39 
 
 		 423 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.76 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.99 
 
 		 847 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  30.36 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.67 
 
 		 817 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.74 
 
 		 738 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.33 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 746 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  45.45 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  45.45 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  45.45 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  45.45 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 682 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  28 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.51 
 
 		 549 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.2 
 
 		 602 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  33.63 
 
 		 637 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 490 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 		 700 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.82 
 
 		 579 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.23 
 
 		 549 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.75 
 
 		 437 aa  89.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  27.71 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 644 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 634 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.54 
 
 		 637 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 		 260 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.73 
 
 		 583 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  32.67 
 
 		 1087 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 769 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 		 721 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.02 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  22.51 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.01 
 
 		 1079 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 		 757 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 874 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.97 
 
 		 566 aa  86.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.02 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.99 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.6 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 697 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.27 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.68 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  32.59 
 
 		 570 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.68 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 1017 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 1711 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 759 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.49 
 
 		 1045 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  25.28 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  22.76 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.61 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.29 
 
 		 728 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.02 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  57.33 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.47 
 
 		 1087 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  57.33 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  57.33 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  41.25 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.09 
 
 		 743 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.65 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 		 775 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.93 
 
 		 728 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  22.76 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  22.76 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  27.38 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  22.07 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  33.16 
 
 		 693 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  23.14 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>