200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8412 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  100 
 
 
123 aa  249  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  67.48 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.1 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  46.34 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  59.52 
 
 
179 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  43.09 
 
 
112 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  56.98 
 
 
194 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49 
 
 
102 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  37.7 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.21 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  32.58 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.65 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  33.58 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  36.36 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.38 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  34.85 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  34.85 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  36.9 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  38.1 
 
 
167 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.25 
 
 
231 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  28.47 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  30.56 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  30.56 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  30.56 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  48.75 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  33.33 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.1 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  58.54 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  33.94 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  43.14 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.97 
 
 
214 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.23 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.23 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.23 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  45.1 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  46.25 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.33 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  51.22 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  38.89 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  32.58 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.82 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  39.22 
 
 
90 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.78 
 
 
128 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.18 
 
 
88 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  31.87 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  41.18 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  41.18 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  30.86 
 
 
202 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.38 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.69 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  51.22 
 
 
60 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  34.57 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  37.88 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.25 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.78 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  42.59 
 
 
231 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  31.25 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  30.43 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  42.59 
 
 
229 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  30.43 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.56 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
234 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.19 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.43 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  24.19 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  33.33 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  28.77 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  36.56 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  39.22 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  33.33 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.55 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.93 
 
 
134 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 
84 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  46.34 
 
 
56 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  27.27 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  30.91 
 
 
169 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.78 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.44 
 
 
155 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.25 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  36.76 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>