73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8396 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  70 
 
 		 306 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  61.95 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  59.04 
 
 		 276 aa  325  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  51.94 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  52.92 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  51.36 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  50.17 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  56.39 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  45.33 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  31.05 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  26.86 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  28.52 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  27.72 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.33 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  27.76 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  27.76 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  29.72 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  29.72 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  29.72 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  25.67 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  27.86 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  29.24 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.53 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.47 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  29.82 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  26.37 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  26.52 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.62 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.68 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  27.17 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  28.47 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  27.8 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  28.52 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.71 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  28.12 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  29.09 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.43 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  21.43 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  27.24 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  26.79 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  20.59 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  22.47 
 
 		 1019 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  28.42 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  26.69 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  25.73 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  27.21 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.84 
 
 		 781 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  29.2 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  21.82 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  22.02 
 
 		 786 aa  52.8  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  28.83 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  28.67 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  28.67 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.52 
 
 		 387 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.72 
 
 		 780 aa  49.7  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  29.61 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  20.07 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  21.03 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  31.21 
 
 		 1095 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  35.11 
 
 		 1038 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  28.4 
 
 		 984 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.1 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  28.26 
 
 		 1055 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.12 
 
 		 781 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  51.06 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  51.06 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  51.06 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  48.94 
 
 		 1038 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 1048 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  33.58 
 
 		 959 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1073  hypothetical protein  27.32 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0101228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>