More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8202 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  62.5 
 
 
332 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  48.62 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  45.77 
 
 
348 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  44.83 
 
 
368 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  43.79 
 
 
327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  40.72 
 
 
363 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  40.06 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
310 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 
314 aa  155  7e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
324 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
325 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.45 
 
 
346 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 
325 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 
322 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
323 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 
323 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 
320 aa  149  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
366 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
354 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 
862 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.28 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 
352 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
340 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
350 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.59 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
321 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 
348 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  31.21 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
321 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  33.01 
 
 
335 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  30.9 
 
 
374 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
343 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  31.31 
 
 
342 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
335 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
329 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  30.79 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
328 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  29.79 
 
 
357 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
400 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  29.93 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.65 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  28.7 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  32.23 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.07 
 
 
354 aa  89.4  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  32.22 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
359 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  29.55 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  31.17 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  29.45 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  27.25 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  29.11 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.14 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  28.01 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  26.38 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  24.69 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>