More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8199 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
522 aa  1045    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  48.64 
 
 
539 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  44.73 
 
 
543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  50.44 
 
 
503 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  47.62 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  44.1 
 
 
525 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  46.73 
 
 
502 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  45.35 
 
 
532 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
551 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  42.72 
 
 
526 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  46.03 
 
 
501 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 
532 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  41.02 
 
 
557 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  45 
 
 
527 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  45 
 
 
527 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  45.04 
 
 
500 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  45 
 
 
527 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  45.04 
 
 
500 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  42.15 
 
 
554 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  43.29 
 
 
518 aa  345  8.999999999999999e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  41.27 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.64 
 
 
608 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
708 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.74 
 
 
600 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.32 
 
 
609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.48 
 
 
545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.77 
 
 
605 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
495 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 
512 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
509 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 
630 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.56 
 
 
534 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.56 
 
 
534 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.47 
 
 
509 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 
539 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  34.54 
 
 
535 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 
541 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.62 
 
 
517 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 
549 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  28.01 
 
 
547 aa  154  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.43 
 
 
517 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.62 
 
 
537 aa  153  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.43 
 
 
517 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.14 
 
 
517 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 
592 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.19 
 
 
592 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 
592 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.14 
 
 
517 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.52 
 
 
592 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.62 
 
 
517 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.95 
 
 
538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.02 
 
 
593 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.48 
 
 
596 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 
610 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.27 
 
 
600 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.57 
 
 
517 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 
520 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  26.93 
 
 
592 aa  144  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.65 
 
 
622 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
5154 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.87 
 
 
601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 
490 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  25.71 
 
 
639 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
807 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
603 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 
552 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.51 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  28.21 
 
 
560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  26.34 
 
 
522 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.34 
 
 
522 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.51 
 
 
517 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
505 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.71 
 
 
610 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.51 
 
 
517 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  24.14 
 
 
518 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.71 
 
 
516 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.29 
 
 
522 aa  136  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.29 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  27.92 
 
 
544 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.67 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 
517 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 
492 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 
535 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.82 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 
551 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  26.49 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  26.89 
 
 
504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  26.64 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  26.64 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  25.79 
 
 
552 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  31.13 
 
 
4575 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
502 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>