More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8152 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
174 aa  353  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  52.23 
 
 
184 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 
185 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
213 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
186 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
189 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  34.75 
 
 
201 aa  84.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 
255 aa  84.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 
230 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
217 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
224 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
224 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
224 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
240 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
224 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
211 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
257 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
222 aa  58.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
237 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
237 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  29.56 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
201 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
179 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
200 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
218 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
221 aa  54.7  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
215 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
235 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
222 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
204 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  37.18 
 
 
224 aa  54.3  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
199 aa  54.3  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.24 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
239 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
215 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  39.62 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  39.68 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  38.46 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.152492 
 
 
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