33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8143 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  100 
 
 		 815 aa  1651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.02 
 
 		 457 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.14 
 
 		 1034 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.22 
 
 		 1034 aa  84.7  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.05 
 
 		 824 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.09 
 
 		 889 aa  73.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.75 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.1 
 
 		 378 aa  72  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  27.53 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.28 
 
 		 440 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.89 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.69 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.76 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.89 
 
 		 773 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.55 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.25 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  28.78 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.42 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.41 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  26.09 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  27.78 
 
 		 606 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.21 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.01 
 
 		 1061 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.42 
 
 		 379 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.52 
 
 		 356 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  30.09 
 
 		 821 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.74 
 
 		 619 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.52 
 
 		 406 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1825 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  33.61 
 
 		 452 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>