35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8100 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  907    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  44.13 
 
 
468 aa  266  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  32.84 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  34.27 
 
 
472 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  32.7 
 
 
465 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  34.55 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  33.62 
 
 
464 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  32.97 
 
 
462 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  34.73 
 
 
472 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  32.14 
 
 
470 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  30.8 
 
 
464 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  37.04 
 
 
472 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  33.12 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  42.64 
 
 
489 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  30.62 
 
 
484 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  46.67 
 
 
498 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  28.31 
 
 
492 aa  93.6  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  42.75 
 
 
468 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  26.85 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  46.79 
 
 
646 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  36.61 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  32.77 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  34.17 
 
 
472 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  34.4 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  33.61 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  32.77 
 
 
497 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  33.96 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  33.96 
 
 
459 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04090  Protein of unknown function (DUF571)  33.59 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.01663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  34.31 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  32.8 
 
 
451 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  28.68 
 
 
508 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  33.33 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  32.26 
 
 
467 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13922  transmembrane protein  31.11 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>