More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8013 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  44.81 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 423 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 433 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 436 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 432 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 450 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  28.39 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  28.65 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  28.12 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 417 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  33.16 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.51 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.25 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.25 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.25 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  34.97 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.93 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.59 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.19 
 
 		 420 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.19 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.93 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.93 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.02 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  30.75 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  30.75 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  30.75 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  30.75 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 432 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  28.01 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.49 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.75 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.82 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.06 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.08 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>