More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7931 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  100 
 
 
452 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.34 
 
 
453 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13030  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  52.36 
 
 
462 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.04 
 
 
453 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  48.97 
 
 
462 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.85 
 
 
454 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.24 
 
 
450 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.24 
 
 
450 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.19 
 
 
459 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.11 
 
 
450 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1579  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.14 
 
 
448 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  48.89 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  48.84 
 
 
476 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  48.88 
 
 
490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  48.72 
 
 
459 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.77 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.34 
 
 
452 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.3 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.58 
 
 
450 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.02 
 
 
453 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.77 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.23 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  40.58 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.89 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  40.32 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.77 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2457  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.82 
 
 
383 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00336692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  40.13 
 
 
449 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.27 
 
 
406 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50.8 
 
 
453 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  48.22 
 
 
459 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.94 
 
 
452 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  50 
 
 
452 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.35 
 
 
450 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.56 
 
 
459 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  41.03 
 
 
448 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  42.07 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2324  fumarate lyase  46.83 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387168  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.39 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.58 
 
 
453 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  40.54 
 
 
473 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1657  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.26 
 
 
404 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.919998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  39.28 
 
 
452 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3324  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.63 
 
 
402 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.93 
 
 
457 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.21 
 
 
460 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2833  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.77 
 
 
464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23357  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1055  fumarate lyase  43.51 
 
 
488 aa  269  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1855  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.89 
 
 
419 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4654  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  46.1 
 
 
464 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0817649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  39.82 
 
 
450 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2188  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  58.33 
 
 
441 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  40.32 
 
 
456 aa  263  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  39.73 
 
 
458 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  42.34 
 
 
455 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  39.01 
 
 
450 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  35.98 
 
 
476 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.26 
 
 
453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  37.64 
 
 
477 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  32.12 
 
 
451 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0298  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.44 
 
 
444 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2084  fumarate lyase  42.92 
 
 
451 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  36.51 
 
 
477 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4076  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.48 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4654  fumarate lyase  45.63 
 
 
451 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179746  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2385  fumarate lyase  42.75 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  37.53 
 
 
450 aa  216  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  34.53 
 
 
445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  34.03 
 
 
454 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3852  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.92 
 
 
384 aa  209  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0767232  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  34.49 
 
 
454 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  33.8 
 
 
454 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  32.01 
 
 
454 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  34.92 
 
 
452 aa  196  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  32.22 
 
 
471 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3852  fumarate lyase  39.7 
 
 
491 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  35.94 
 
 
451 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0617  fumarate lyase  40.42 
 
 
446 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  32.39 
 
 
455 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  32.46 
 
 
455 aa  190  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  33.57 
 
 
483 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  36.75 
 
 
456 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  34.53 
 
 
483 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  35.13 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  32.06 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0910  fumarate lyase  40.1 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1071  fumarate lyase  45.15 
 
 
381 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3729  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.13 
 
 
354 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  31.74 
 
 
430 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  31.41 
 
 
446 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6130  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.67 
 
 
352 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  31.94 
 
 
458 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  31.59 
 
 
447 aa  156  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>