More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7852 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  100 
 
 		 489 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  47.56 
 
 		 511 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  47.56 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  47.56 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  38.16 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  37.93 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 501 aa  140  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 497 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 490 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.02 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.22 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 513 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.85 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 484 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.94 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 474 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.55 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 468 aa  94  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23.69 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23.69 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23.69 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.69 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 467 aa  93.6  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.85 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  23.38 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 509 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.77 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 453 aa  90.5  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  23.24 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.37 
 
 		 471 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.31 
 
 		 456 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  27.9 
 
 		 497 aa  90.1  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25 
 
 		 443 aa  90.1  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 462 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  32.03 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  29.68 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.75 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  25.21 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  25.21 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  25.21 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>