150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7843 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
137 aa  272  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
136 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.16 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2541  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.57 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.7405  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  35.77 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  34.4 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.16 
 
 
750 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  41.73 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0857  hypothetical protein  35.43 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.079747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  38.21 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
187 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
151 aa  59.3  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 
207 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  35.71 
 
 
282 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  44 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.74 
 
 
655 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.97 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.4 
 
 
616 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  39.32 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  40.17 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.53 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
713 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.11 
 
 
738 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.85 
 
 
1039 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 
155 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  34.92 
 
 
197 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
154 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 
697 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
288 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0713  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.59 
 
 
694 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 
855 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  33.87 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.03 
 
 
743 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.54 
 
 
800 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 
722 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.75 
 
 
573 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  33.9 
 
 
746 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  37 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  34.92 
 
 
713 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.01 
 
 
281 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  34.43 
 
 
716 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0704  hypothetical protein  39.37 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  48 
 
 
765 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  29.32 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
745 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5442  putative signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 
754 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  29.48 
 
 
753 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  38.3 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  33.87 
 
 
743 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.93 
 
 
591 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
355 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 
693 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.17 
 
 
1045 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
216 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  30.89 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2117  indolepyruvate oxidoreductase, alpha subunit  25.69 
 
 
613 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  30.95 
 
 
771 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.61 
 
 
199 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>