94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7796 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  59.32 
 
 
267 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  61.63 
 
 
273 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  56.59 
 
 
282 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  57.71 
 
 
274 aa  289  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  56.59 
 
 
282 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  56.59 
 
 
282 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  56.2 
 
 
282 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  56.4 
 
 
282 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  54.86 
 
 
282 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  54.02 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  56.22 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  53.67 
 
 
268 aa  281  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  53.64 
 
 
272 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  53.64 
 
 
272 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  52.26 
 
 
273 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  54.62 
 
 
315 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  52.9 
 
 
310 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  53.91 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  54.94 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 
271 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  55.16 
 
 
285 aa  271  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  53.64 
 
 
273 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  53.78 
 
 
284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  54.51 
 
 
275 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  52.92 
 
 
273 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  51.36 
 
 
306 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  53.75 
 
 
262 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  51.59 
 
 
264 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 
273 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  51.57 
 
 
269 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  49.24 
 
 
267 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  48.75 
 
 
313 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  52.21 
 
 
271 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  51.81 
 
 
271 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
267 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  48.86 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  47.79 
 
 
244 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  48.16 
 
 
278 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  46.61 
 
 
288 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  51.98 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  43.51 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  45.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
241 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  46.5 
 
 
265 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  43.13 
 
 
270 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 
277 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
302 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  43.57 
 
 
305 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  40.89 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 
296 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  38.02 
 
 
285 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 
294 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 
276 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 
283 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 
318 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 
281 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
272 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  37.35 
 
 
272 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  36.98 
 
 
297 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  35.43 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 
241 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
263 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  31.7 
 
 
280 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  54.55 
 
 
48 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
295 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  28.81 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
761 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  38 
 
 
91 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  28.87 
 
 
131 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  34.62 
 
 
70 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 
493 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21690  hypothetical protein  31.17 
 
 
144 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00102012  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10023  transcriptional regulator  30.95 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.07 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.07 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
182 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
181 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 
218 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
274 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
816 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>