More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7736 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  34.65 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  33.9 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.52 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  35.25 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.8 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.8 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  28.8 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.8 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.8 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.8 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.8 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  34.13 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  34.13 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  33.75 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  38.81 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>