129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7733 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  39.18 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  38.89 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  38.89 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  33.78 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  30.37 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  32.41 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  33.09 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  30.34 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.34 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  30 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  32.56 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  33.59 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  38.96 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  38.35 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  37.59 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3054  hypothetical protein  30.06 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000764336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  27.03 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  28.38 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  35.25 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  29.76 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  31.65 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  26.99 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.23 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  32.12 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  34.32 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  28.68 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  29.03 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  29.85 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  28.12 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  31.54 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  29.1 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  29.86 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  33.85 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  26.92 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  31.25 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  26.56 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  32 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  32.41 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  32.31 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  28.24 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  32.31 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  28.03 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  28.95 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  30.08 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  26.16 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  28.89 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  28.89 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  31.72 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  25.87 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  28.68 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  31.5 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  30.15 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  26.12 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  29.17 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  28.46 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  28.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  28.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  28.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  30.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  28.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  30.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  30.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  30.28 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  28.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  28.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  30.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  25.53 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  31.39 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  30.37 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  28.28 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  30.32 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  36.15 
 
 		 182 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  23.3 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  28.12 
 
 		 175 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  29.85 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  29.32 
 
 		 181 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  29.68 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  29.12 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  29.32 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  28.79 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  28.73 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  29.23 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  30.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  30.23 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  25.18 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  30.16 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  26.36 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  23.44 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0673  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.944503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  28.47 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  28.89 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>