250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7682 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
224 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  69.38 
 
 
243 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  59.9 
 
 
268 aa  258  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  63.64 
 
 
218 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  57.14 
 
 
254 aa  248  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  60.3 
 
 
366 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  55.88 
 
 
221 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  54.55 
 
 
249 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  51.9 
 
 
274 aa  223  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  51.94 
 
 
262 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  54.3 
 
 
246 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  54.85 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  52.68 
 
 
273 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  51.43 
 
 
305 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  54.59 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  51.38 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  52.91 
 
 
246 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  52.38 
 
 
225 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 
270 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  43.56 
 
 
225 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  42.67 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  44 
 
 
250 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 
229 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  50.7 
 
 
239 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  43.86 
 
 
243 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  45.41 
 
 
314 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  40.34 
 
 
247 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  40.34 
 
 
247 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  40.34 
 
 
247 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  47.77 
 
 
224 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  43.33 
 
 
242 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  43.19 
 
 
225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  46.7 
 
 
218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  44.34 
 
 
225 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  42.38 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  47.16 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  45.6 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  46.59 
 
 
270 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  46.59 
 
 
270 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  49.75 
 
 
217 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  45.27 
 
 
219 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  45.27 
 
 
219 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  45.89 
 
 
235 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  41.62 
 
 
217 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  46.27 
 
 
219 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  45.24 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  32.98 
 
 
215 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  32.98 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  32.98 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  32.98 
 
 
215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  34.04 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.61 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  34.04 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  34.04 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  34.04 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  39.39 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  44.32 
 
 
213 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  40 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  40 
 
 
195 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  34.04 
 
 
215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.98 
 
 
215 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  40.72 
 
 
218 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  35.41 
 
 
218 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  39.41 
 
 
192 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  35.33 
 
 
214 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  40.76 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 
215 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  33.97 
 
 
223 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  40.13 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  32.74 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  32.74 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  38.83 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  39.88 
 
 
205 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.98 
 
 
239 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
230 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  34.13 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  33.96 
 
 
214 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  32.68 
 
 
219 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  29.05 
 
 
209 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  33.78 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  35.67 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  33.72 
 
 
241 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  33.96 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  34.15 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  34.15 
 
 
205 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  38.59 
 
 
226 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  35.63 
 
 
259 aa  99  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  34.45 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  35.29 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  31.33 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  32.56 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  29.44 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  30.54 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  33.49 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  33.99 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  37.95 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  30.81 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  31.94 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>