More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7619 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.07 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.63 
 
 
237 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.04 
 
 
231 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.26 
 
 
232 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
231 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
234 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
234 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
245 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
244 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
241 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
270 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
246 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  43.03 
 
 
245 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
245 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
263 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
250 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
244 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
245 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
257 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
252 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
246 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
242 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
236 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
236 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
236 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
236 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
250 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
237 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.06 
 
 
257 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
237 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  38.33 
 
 
309 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
233 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
239 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
227 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  35.43 
 
 
245 aa  136  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
250 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
236 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.96 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
240 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
229 aa  121  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  30.13 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
229 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  32.33 
 
 
263 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
243 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
248 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
236 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  31.97 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  33.5 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
286 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.43 
 
 
277 aa  92  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  43.45 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  37.81 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
307 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
307 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
307 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  40 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.23 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02469  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01530)  32.37 
 
 
268 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
234 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
302 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
254 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
233 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
278 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
284 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3196  short chain dehydrogenase  25.96 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3437  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  25.96 
 
 
234 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 
316 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07999  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>