16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7615 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  954  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  66.12 
 
 
482 aa  540  1e-152  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  32.83 
 
 
518 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  31.71 
 
 
556 aa  192  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  30.26 
 
 
545 aa  176  1e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  26.91 
 
 
439 aa  79  2e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  26.04 
 
 
475 aa  68.6  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.85 
 
 
565 aa  63.2  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  27.86 
 
 
455 aa  63.2  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 
442 aa  55.8  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  26.85 
 
 
505 aa  54.3  5e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  28.34 
 
 
339 aa  53.5  7e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  26.56 
 
 
443 aa  50.4  6e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  30.63 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  34.71 
 
 
450 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  26.94 
 
 
443 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>