27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7614 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  607  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  74.15 
 
 
303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
301 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  41.24 
 
 
298 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  40.89 
 
 
298 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  34.91 
 
 
304 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.93 
 
 
295 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 
310 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 
314 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 
303 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 
273 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  33.46 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  30.09 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 
288 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  29.74 
 
 
318 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  30.43 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  26.44 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  30.52 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  30.52 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  29.17 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>