More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7606 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  62.33 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 489 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.11 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.37 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.23 
 
 		 234 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  47.49 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.43 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  48.83 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.95 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.66 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.77 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.26 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.58 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  49.33 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  49.53 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.71 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 229 aa  184  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.32 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  47.64 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.51 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  46.05 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.11 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.51 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.18 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.9 
 
 		 241 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  48.61 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  43.42 
 
 		 228 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.06 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 234 aa  177  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.79 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.32 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  47.44 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  46.89 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 223 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.13 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0231149  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.29 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>