257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7575 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  100 
 
 
54 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  81.48 
 
 
54 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  81.48 
 
 
54 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  94.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4730  50S ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4816  50S ribosomal protein L33  79.63 
 
 
54 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.504852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 
55 aa  87  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 
55 aa  87  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 
55 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 
55 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 
55 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 
55 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  76.92 
 
 
56 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 
55 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  76.92 
 
 
55 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12094  50S ribosomal protein L33  77.78 
 
 
54 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704629  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 
55 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  67.39 
 
 
54 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 
55 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  51.02 
 
 
51 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  53.7 
 
 
56 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 
51 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 
55 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  53.19 
 
 
51 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  46.3 
 
 
56 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  59.18 
 
 
51 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  51.92 
 
 
56 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  63.04 
 
 
54 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  63.04 
 
 
54 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12292  predicted protein  50.91 
 
 
57 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.855117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  60 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0543  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0519  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  54.17 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
51 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001819  LSU ribosomal protein L33p  44.44 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000810994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  48.15 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0090  ribosomal protein L33  46.94 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0225  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1711  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  56.52 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  60 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1990  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2140  ribosomal protein L33  48.98 
 
 
51 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>